منشأ این عفونت‌ها و جایی که این عفونت‌ها از آن ریشه می‌گیرند، مهم‌ترین و بارزترین وجه تمایز بین این دو بیماری است. (منشا بیماری کلامیدیا باکتری کلامیدیا تراکوماتیس و منشا بیماری سوزاک باکتری گنوکوک یا نایسریا گونوره آ است.)
کلامیدیا (کلامیدیا تراکوماتیس) می‌تواند در مجرای ادراری یا رکتوم زن و مرد و در مهبل یا دهانه رحم زنان دیده شود. اگرچه سوزاک (Neisseria gonorrhoeae) هم در مجرای ادراری یا رکتوم زن یا مرد یافت می‌شود، اما همچنین می‌تواند مقعد، دهان و حتی لوله‌های فالوپ زنان را نیز آلوده کند.

سوزاک چیست؟
سوزاک یک عفونت باکتریایی شایع است که به راحتی با داروهای آنتی بیوتیکی درمان می شود. این بیماری مقاربتی بوده و اکثر مبتلایان علائمی ندارند.سوزاک یکی از شایع ترین بیماریهای مقاربتی استسوزاک – به ویژه برای نوجوانان و افراد ۲۰ – ۳۰ ساله – یک عفونت جنسی بسیار شایع است. این بیماری گاهی ” تورم پوستی” یا “قطره” نامیده می شود.
نحوه ی انتقال سوزاک
این بیماری از طریق رابطه جنسی واژنی، مقعدی و دهانی انتقال می یابد. عفونت از طریق ترشحات جنسی – مانند مایع منی (آب)، پیشآب و ترشحات واژنی – منتقل